Tassonomia

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Tassonomia

 

La tassonomia è la scienza e il metodo per classificare.
Le tassonomie dispongono gli oggetti da classificare in ordine gerarchico.
La tassonomia Linneiana è un metodo di classificazione degli organismi viventi originariamente proposto da Carl Linnaeus a metà del Settecento.
La più importante innovazione di Linnaeus, che è tuttora l’aspetto più importante del suo sistema, è l’introduzione della nomenclatura binomiale, che combina il genere e specie. La specie umana, ad esempio, è definita dal binomio "Homo sapiens". Questo binomio non è associato a nessuna altra specie di organismi.
Tutte le specie sono classificate secondo una struttura gerarchica a partire dai regni. I regni sono divisi in phyla (singolare: phylum). I phyla sono divisi in classi; le classi, a loro volta, in ordini, famiglie, generi e specie (singolare: specie).
A partire dagli anni settanta, con lo sviluppo della tecnologia per sequenziare il DNA, è diventato possibile studiare l’evoluzione molecolare e definire relazioni evolutive fra specie, attraverso il confronto delle loro sequenze geniche. Le sequenze geniche di organismi evolutivamente vicini hanno, in genere, un alto grado di somiglianza, mentre le molecole di animali distanti dal punto di vista evolutivo non si assomigliano molto. Lo studio della filogenesi a livello molecolare utilizza questo tipo di dati per costruire degli alberi che rappresentano l’evoluzione più probabile dei diversi organismi.


La filogenesi molecolare ha chiarito molti aspetti incerti dei rapporti evolutivi fra specie e si è dimostrata di estrema utilità nello studio dei rapporti evolutivi fra organismi piccoli e microscopici (come alcuni insetti, nematodi, protozoi e batteri) che sono di vitale importanza per gli ecosistemi, ma i cui aspetti morfologici sono difficili da identificare e confrontare.  
 Per motivi tecnici, tuttavia, per avere un quadro accurato dei rapporti evolutivi, nella maggior parte dei casi è necessario ottenere le sequenze del DNA di molti geni diversi degli organismi che si vuole studiare e confrontarle simultaneamente.

Tuttavia, l’enorme numero di specie presenti sulla terra impedisce, di fatto, l’utilizzo di questo tipo di approccio per uno studio comprensivo.

Potremmo superare questa difficoltà, se riuscissimo a trovare un gene la cui sequenza è significativamente diversa tra le varie specie: tale sequenza costituirebbe un marcatore affidabile per permetterci di identificare rapidamente le varie specie.
E’ proprio questa l’idea che sta alla base del codice a barre del DNA
In questo caso, l’obiettivo non è quello di studiare i dettagli delle relazioni evolutive, ma piuttosto quello di fornire un catalogo generale della diversità, di facile accesso per chiunque voglia rapidamente ma accuratamente identificare un organismo.

E’ nati il CBOL (il Consorzio per il Codice a Barre della Vita, Consortium for the Barcoding Of Life) è un movimento internazionale che associa musei di storia naturale, erbari, giardini zoologici, istituti di ricerca, agenzie governative e intergovernative, associazioni non governative, compagnie private e altre organizzazioni coinvolte nella ricerca tassonomica e nei temi della biodiversità.

Ad oggi, questo movimento coinvolge più di 100 organizzazioni in piu di 40 paesi nei 6 continenti (Fig. 5).

Fig. 5 Il CBOL nel mondo

Nella banca dati, per ogni specie sono catalogate tutte le sequenze di codice a barre disponibili, il luogo e il modo in cui sono stati raccolti i campioni, i link ad altri siti utili e le relative immagini.

Fig. 7 Una pagina del sito www.barcodinglife. org

Per ora lo sforzo maggiore si è concentrato su alcuni gruppi tassonomici particolari: Pesci, Insetti e Uccelli. Mentre il marcatore coxI sembra funzionare molto bene per tutti i gruppi animali, sono allo studio marcatori diversi per Piante e Funghi.
Il Genoma Mitocondriale

Perchè usare il DNA mitocondriale per il codice a barre degli animali?

  • I risultati sperimentali hanno permesso di individuare un gene mitocondriale che consente l’identificazione della maggior parte delle specie animali.

Nel regno vegetale, i geni mitocondriali non sono sufficientemente diversi per consentire di distinguere specie vicine. Sono allo studio una o più regioni di DNA utilizzabili per l’identificazione delle piante.
Nel 2020? Tra breve sarà possibile definire i codici a barre ovunque e all’istante.

 

 

  • Dati in pochi minuti
  • Costi bassissimi
  • Collegamento alle banche dati di riferimento
  • Un GPS tassonomico
  • Utilizzabile anche dai non-specialisti

 

A cosa servono i codici a barre?
Strumento per identificare le specie:

  • Vettori di malattie, infestanti in agricoltura, specie invasive
  • Indicatori ambientali, specie protette
  • Possibilità di partire da minime quantità di campione, da campioni mal conservati, dal contenuto dell’intestino, da feci

Strumento di ricerca per migliorare la tassonomia a livello di specie:

  • Superando le difficoltà legate agli stadi vitali, al dimorfismo sessuale, al processamento subito dal campione da esaminare:
    • da quale specie deriva questa larva/ girino/ bistecca?
    • Questi campioni, morfologicamente simili, appartengono alla stessa specie?

Fonte: http://www.marconigorgonzola.gov.it/DrupalStorage/files/barcoding(2).doc

Sito web da visitare: http://www.marconigorgonzola.gov.it

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